在第二部，故事发生在钢铁天使1的29年后，世界已经成为了一个可怕的废墟，被各种妖魔鬼怪统治着。冰冷的钢铁和暴躁的火焰交织成了恐怖的景象，像是魔界的一角。当一个勇敢的高中女学生穿过神社的地窖的时候，她们不敢相信自己的眼睛——钢铁天使久留美从佛像中走出来了！她们的心脏怦然跳动，因为她们知道，这个机器天使将拯救他们不仅仅是在这个荒凉的世界。但是接着，久留美的两个姐妹也从沉睡中被惊醒，她们也是出乎意料地醒来了。这三位姐妹不再是孤军奋战的机器天使，而是共同面对着无尽的妖魔鬼怪。她们的身手矫健无比，神勇无比，她们的光芒闪耀在这个黑暗的世界。最终，她们不仅打败了敌人，更成为了最亲密的姐妹。她们的名字被记载在历史的篇章中，被无数人景仰和崇拜。g